Van Der Beek ocupó la mayor parte de su tiempo después el torrente de Dawson persiguiendo otros papeles televisivos notables, que incluyen No confíes en el B—- En el apartamento 23, en el que interpretó una versión de sí mismo.
También se casó con su esposa Kimberly y comparten seis hijos pequeños: Olivia, Joshua, Annabel, Emilia, Gwendolyn y Jeremiah.
El nacimiento de su hijo menor. se mantuvo en secreto después de que la familia sufriera dos pérdidas de embarazo dos veces seguidas. La esposa de Van Der Beek ha sufrido trágicamente cinco pérdidas de embarazo en total.